Внутренние водные пути Единой глубоководной системы включают 45 судоходных шлюзов в семи бассейнах европейской части страны. Система связывает Балтийское, Белое, Каспийское, Азовское и Чёрное моря через Волго-Балтийский путь, Волго-Донской канал и Волго-Камский каскад. Пропуск судов через шлюзы определяет фактическую пропускную способность всего межбассейнового транзита.

В 2026 году система вошла в период масштабной модернизации. Запущена первая очередь Багаевского гидроузла на Дону, начата временная эксплуатация Городецкого гидроузла на Волге. Оба объекта наращивают гарантированные глубины и пропускную способность участков, которые исторически были узкими местами для крупнотоннажного флота.

Для агрологистики модернизация ЕГС имеет прямое денежное значение. После остановки южного морского экспорта речной транзит стал замещающим каналом: из волжских портов на Северо-Запад доставлено почти 940 тыс. тонн зерна за полтора месяца. Каждая тысяча шлюзований в сезоне означает сотни тысяч тонн груза, которые не требуют вагонов.